Nee, het composteringsproces is er op gericht om kiemkrachtige zaden en ziektekiemen af te doden. Door de hoge temperaturen en de vochtige omgeving heeft de compostering immers een hygiëniserend effect. Hoe hoger de temperatuur, hoe sneller de kiemen en zaden gedood worden. In de professionele compostering kan er zodanig gestuurd worden dat deze micro-organismen sowieso afsterven.
Onafhankelijke labo’s testen elk staal dat Vlaco vzw neemt op kiemkrachtige zaden. 500ml Vlaco-compost wordt gemengd met 2000ml witveen, vochtig gemaakt en als een laag van 2 tot3 cmin een platte schaal gebracht. Deze schaal plaatst men in een ruimte met relatieve vochtigheid van zo goed als 100% en bij een temperatuur van21°C. Ook bij opslag van Vlaco-compost ziet men er op toe dat er geen nieuwe onkruidzaden in de hoop kunnen waaien.
Vlaco vzw doet regelmatig onderzoek naar de hygiëniserende werking van het composteringsproces. Het labo voor fytopathologie van de KU Leuven onderzocht welke plantpathogenen gedood worden tijdens het composteringsproces. Uit het resultaat bleek dat cysten- en wortelknobbelaaltjes het snelst gedood worden (al na enkele uren of dagen van compostering bij 45-60°C). Maar ook het resistente Knolvoet en zelfs het zeer hardnekkige Tabaksmozaïekvirus (TMV) worden probleemloos gedood. TMV wordt tijdens het composteren van gft-afval geïnactiveerd binnen drie en zeven weken. Tijdens het composteren van groenafval wordt het virus geïnactiveerd na 6 tot 11 weken.